在百度分公司开通推广服务与在百度代理商开通推广服务的主要区别如下：
1：在百度分公司直接开通推广服务，可以与百度官方平台直接沟通合作，享受官方平台提供的服务和支持。分支机构是百度的直属机构，可以更好地理解和执行百度的政策法规，也可以更快地获得官方的支持和反馈。根据企业业务分配专业运营顾问进行账户管理和优化（不收取额外费用）。
2：通过百度代理商开通推广服务，除了支付推广费外，还需要每年支付额外的运营服务费。
综上所述，百度分公司开通推广服务与百度代理商开通推广服务的主要区别在于合作方式和提供的服务内容。在百度分公司开通推广服务可以享受官方服务和支持，而通过百度代理商开通推广服务则需要支付额外的代理费。企业在选择开放推广服务的方式时，应根据自身情况和需求进行选择。